Программа предусматривает существенное увеличение количества водоемов, в которых можно будет купаться. В частности, предполагается воссоздать проточные водоемы. На реках, впадающих в них, построят очистные сооружения.
Таким образом, вода подвергнется сразу нескольким уровням очистки – от механического, до микробиологического. Уже в 2004 году проводится реконструкция Перекопского пруда, каскада прудов в Лефортовском и Воронцовском парках, Путяевских прудов, трех водоёмов в Зеленограде, и двух в парке «Терлецкая дубрава».
Всего же предстоит облагородить свыше 500 малых рек и различных водоемов. Программа по восстановлению малых рек и водоемов столицы рассчитана на ближайшие семь лет. На нее предполагается направить около 16 млрд руб., большей частью, из городского бюджета.